继杰森·伯恩后，另一美国中情局特工艾伦•克劳斯Aaron Cross（杰瑞米·雷纳 Jeremy Renner 饰）亦将身陷险境。因为“杰森·伯恩事件”，令中情局的特工行动“绊脚石Treadstone”被公开，为了隐瞒其它特工行动，以拜亚ret. Colonel Eric Byer（爱德华·诺顿 Edward Norton 饰）为首的美国中情局，正计划铲除过去数十年来发展的特工行动，包括“结果Outcome”行动当中，体能和智能更“先进”的“5号”特工艾伦•克劳斯，展开横跨全球的逃杀。而艾伦•克劳斯剩下的唯一希望，竟然就是过去四年来，不断在背后监控和研究其活动的科学研究员玛泰博士Dr. Marta Shearing（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）……